Professor Nagasaki en Professor Kawaguchi van Center for Genomic Medicine, mastersopleiding medicijnen, universiteit van Kyoto

De hoogwaardige TS-2483XU-RP versnelt en stroomlijnt de analyse van genoomgegevens.

  • Achtergrond

    Professor Nagasaki en professor Kawaguchi van het centrum voor genomische geneeskunde, mastersopleiding medicijnen, universiteit van Kyoto bestuderen genomen, metabolieten en gezondheidsinformatie op zoek naar ziektegerelateerde factoren bij mensen als hun hoofddoel. Ze voeren grootschalige data-analyses uit van tienduizenden mensen.

  • Uitdagingen

    Het genoom bestaat uit 3 miljard basisparen (3 GB) per persoon, en bij het analyseren van het genoom moet een extreme hoeveelheid gegevens worden verwerkt. Daarom was een hoogpresterende opslag vereist. De hoogleraren gebruikten eerder RAID-opslag die rechtstreeks op elke computerserver was aangesloten als lokale near-line opslag om alle gegevens te verwerken. Met deze methode was de I/O-snelheid een bottleneck, en de gegevens waren letterlijk verspreid over verschillende opslageenheden, waardoor het voor de onderzoekers moeilijk was om deze te gebruiken.

Oplossing

De hoogleraren installeerden drie QNAP TS-2483XU-RP voor een hoge I/O-snelheid met beschikbaarheid van onderdelen na de garantie, kostenefficiëntie en eenvoudiger draagbaarheid (wanneer ze fysiek de NAS moeten verplaatsen). De TS-2483XU-RP is een krachtige NAS met 24 schijfhouders en Intel® Xeon® E-processors met maximaal 128 GB DDR4 ECC-geheugen en inclusief twee 10GbE SFP+-poorten. De hoogleraren installeerden ook andere high-speed gedistribueerde opslag en integreerden ze met near-line opslag bestaande uit QNAP NAS om data apart op te slaan op basis van het doel ervan. De analysegegevens worden opgeslagen op de snelste opslag en basisgegevens worden opgeslagen als koude gegevens, die essentieel zijn maar zelden worden gebruikt.

Resultaten

De hoogleraren kregen een complete suite met QNAP-opslag, waardoor ze zowel de leer- als beheerkosten aanzienlijk konden verlagen met een gecentraliseerde beheerinterface en een op GUI gebaseerde configuratie. Een QNAP NAS is eenvoudig te installeren en is onmisbaar geworden als medium voor het uitwisselen van gegevens met externe instellingen. Het stelde hen in staat het gebruikersgemak te verbeteren door gecentraliseerde gegevenstoegang en een kostenefficiënt opslagsysteem te bouwen dat aan de I/O-vereisten voldoet. De hoogleraren bouwen een hybride cloud-omgeving die drie infrastructuren combineert: servers op locatie, publieke clouds en interdisciplinaire High Performance Computing Infrastructure (zoals supercomputers) op het academische informatienetwerk SINET*. Niet alleen als de near-line opslag die oorspronkelijk was voorzien, maar de hoogleraren gebruiken de QNAP NAS ook als een directe I/O-omgeving van computerclusters. In de toekomst streven de hoogleraren ernaar een meer naadloze omgeving op te zetten waarin de data van elk platform gecentraliseerd zijn, en gebruikers de gewenste data kunnen gebruiken zonder zich bewust te zijn van de verschillen in platforms en applicaties.

*SINET is de academische IT-netwerkinfrastructuur voor Japanse universiteiten en onderzoeksinstituten.

Kies specificatie

      Toon meer Minder

      Deze website in andere landen/regio's:

      open menu
      back to top